1939年内蒙古与东北交界处的荒漠，抗日英雄燕双鹰为报家仇与汉奸土匪交战，发现隶属日军731部队的人体试验室“208防疫站”正在用中国人试验可怕的二号病毒，并用之制成细菌炸弹。为了粉碎日军阴谋，打击投敌的土匪，燕双鹰与国民政府特派员周晓英一同深入土匪的聚集地五龙镇。周晓英想收编这些土匪为己所用，为此大耍手段。燕双鹰消灭土匪和日军试验室，孤军奋战，百折不挠。二人斗智斗勇，又相互敬佩。最终燕双鹰带领抗日武装，与日军和老刀把子、刘大麻子，东山好等几股土匪展开艰苦卓绝的战斗。大漠深处，铁路线上，208防疫站，处处都是他们的战场。燕双鹰的勇气和毅力鼓舞着战友们，几番折挫，几番奋起，最后，他带领着同志们与汉奸土匪在五龙镇展开决战，终于消灭了这几股投敌卖国的匪帮，铲除日军试验室，将二号病毒烧为灰烬。
